RNA-seqのリードをSTARでゲノムへ高速にマッピングする

STARは高速なRNA-seq用のマッピングツール。

インストール

まずSTARをインストールする。

git clone git@github.com:alexdobin/STAR.git
make STAR

マニュアルのPDFも作りたい場合は以下のコマンドを入力する。ただし latexmk がいる。

make manual

マニュアルのPDFは以下に落ちているので必須ではない。

使い方

(つづく)

2015/01/10