RNA-seqのリードをSTARでゲノムへ高速にマッピングする
STARは高速なRNA-seq用のマッピングツール。
インストール
まずSTARをインストールする。
git clone git@github.com:alexdobin/STAR.git
make STAR
マニュアルのPDFも作りたい場合は以下のコマンドを入力する。ただし latexmk がいる。
make manual
マニュアルのPDFは以下に落ちているので必須ではない。
使い方
(つづく)
2015/01/10