サイドバー左上の “>>” を押すと、サイドバーを隠すことができます。

2012/09/29

ENCODE勉強会. Dong X et. al. “Modeling gene expression using chromatin features in various cellular contexts”

2012/08/25

R 入門 — 統計解析初歩から NGS 解析まで

微研夏の学校、琵琶湖

実習はありませんが、一緒に手を動かしてみたいひとは事前の準備を!

レジュメ

• RNA-seq データ解析の基礎
• 付録: R/Bioconductor の基礎

2012/08/24

「RとBioconductorによるNGS解析」

統合データベース講習会：AJACSみちのく2, 東北大学医学部

実習はありませんが、一緒に手を動かしてみたいひとは事前の準備を! 以下の各ページの準備の項を参考にしてください。

レジュメ

• 第1限: R/Bioconductor の基礎
• 第2限: RNA-seq データ解析の基礎
• 第3限: ChIP-seq データ解析の基礎

データやソースコードについても各章の準備の項に書いてあります。

スライド

イントロダクションに使ったスライドは以下にあります。

• https://github.com/dritoshi/NGS_analysis_with_R_Bioconductor

おまけ

質問のあった NCBI GEO のデータをRに読み込む方法について書きました。以下をご覧ください。

• Bioinformatics Tips

2012/02/22

R + Bioconductor によるChIP-seq データ解析の基礎

Rでつなぐ次世代オミックス情報統合解析研究会, 理化学研究所 横浜研究所

• R + Bioconductor によるChIP-seq データ解析の基礎, (ソースコード、スライドなど)